Após perderem as Regionais, o Glee Club está de volta ao nível mais baixo da McKinley High. Quando a escola se vê frente a novos cortes de orçamento, Mr. Shuester pressiona os alunos a ajudarem a recrutar novos membros para o clube. Enquanto Finn tenta trazer Sam, um aluno novato, Rachel tenta impedir que Sunshine entre, por medo de perder os seus solos.
Quando Brittany e os demais membros tentam convencer Mr. Schuester a deixá-los executarem um número da Britney Spears, ele fica relutante, por achar que ela não é um bom exemplo. Enquanto isso, um inseguro Will está curioso sobre o novo namorado de Emma, Dr. Carl Howell, então ele convence Emma a trazê-lo para a escola para conversar com os garotos sobre higiene dental. Enquanto o doutor inspira as garotas a levar sua higiene pessoal mais a sério, Will passa a se sentir pior consigo mesmo.
Finn tem uma crise existencial quando ele acredita que vê o rosto de Jesus em seu sanduíche de queijo grelhado. Ele passa a orar para ele e sugere que o Glee tenha uma semana dedicada a músicas religiosas. Kurt, que é ateu, não concorda. Apesar disso, quando seu pai tem um infarto, os membros cantam para tentar fazer com que ele melhore. Sue também se questiona sobre o que acredita, e conversa sobre isso com sua irmã Jean.
Depois que Puck é preso, Will organiza uma competição entre os integrantes do clube, valendo um jantar pago em um restaurante para os dois que cantarem o melhor dueto. Rachel convence Finn a desistir de tentar ganhar para fazer com que Sam vença e se sinta parte do clube. Enquanto isso, Artie e Brittany começam a desenvolver um romance.
Mr. Schue faz o Glee Club performar "The Rocky Horror Picture Show" para o musical anual da McKinley, ao saber que é a peça preferida de Emma. Eles encontram dificuldades por algumas pessoas acharem que a peça é forte demais para ser apresentada em uma escola. Sue tenta se aproveitar disso para denunciar o clube por conteúdo inadequado, mas falha, já que Will decide cancelar a apresentação para a escola e fazer apenas para eles mesmos.
Will organiza uma competição entre os garotos e garotas do clube, em que cada grupo terá que cantar um mash-up com canções típicas do sexo oposto. Depois de Finn e Sam encontrarem uma maneira não convencional de controlar seus impulsos, pensando na treinadora Beiste, outros membros do Glee Club começam a usar isso também como uma estratégia. Mas quando ela descobre o que eles estão fazendo, terão que dar algumas explicações. Enquanto isso, Kurt passa por dificuldades com a perseguição de um jogador de futebol, mas encontra ajuda durante uma visita a escola de um Glee Club que será concorrente deles, e Puck tenta ajudar Artie como forma de não ter que voltar para o reformatório.
Quando Mr. Schuester fica doente, uma professora substituta dá aulas de espanhol e comanda o Glee Club, conseguindo assim conquistar todos do New Directions. Enquanto isso, quando o Diretor Figgins também fica doente, Sue é nomeada a nova diretora e usa o seu poder na escola.
Kurt inicia a organização do casamento de seu pai, Burt, com a mãe de Finn, Carole, e continua passando por problemas com um homofóbico. Alguns membros do clube e Burt tentam ajudar, enfrentando Karofsky. Enquanto isso, Finn tenta provar que ainda é um líder, depois de ter perdido a posição de quarterback para Sam. Quando sabe que Rod, jornalista com quem havia saído, vai se casar, Sue decide fazê-lo também, com ela mesma, e sua mãe, Doris, aparece para uma visita surpresa.
Chegaram as Sectionals. Este ano, a competição inclui The Hipsters e Dalton Academy Warblers. Com Kurt na Dalton Academy, o New Directions recruta Lauren Zizes como décimo segundo membro, para poder competir. Will decide utilizar membros que pouco destacaram nas outras apresentações do clube, para dar a todos uma oportunidade, mas Rachel, Finn e Mercedes não concordam. Enquanto isso, Santana conta para Rachel que Finn havia perdido a virgindade com ela no ano anterior e estava mentindo, o que provoca um grande problema na relação dos dois. Rachel beija Puck e conta para Finn, que termina o namoro.
Finn tenta trazer um pouco do Natal para McKinley, e Artie descobre que Brittany ainda acredita no Papai Noel. Enquanto isso, os professores sorteiam seus amigos secretos e Sue tenta manipular as entregas a seu favor.
Treinadora Bieste e Mr. Schuester conspiram em unir o clube do carol e time de futebol; Sue tenta, desesperadamente, ganhar as nacionais das cheerleaders; New Directions fará uma performance de Thriller de Michael Jackson.
Chegou o Dia dos Namorados. No McKinley High todos estão apaixonados. Enquanto casais se formam, outros se separam. Sam e Quinn percebem que o relacionamento entre os dois existe apenas por interesse e decidem se afastar. Um amor sincero entre Puck e Lauren está prestes a começar devido a uma brincadeira "inocente". Rachel convence Brittany a mudar o visual, e Santana decide se trajar como Rachel por inveja. Artie se apaixona pelo novo visual de Brittany e junto dos amigos do New Directions prepara um serenata em comemoração ao namoro. Emma esconde um segredo. Kurt pensa em se declarar para Blaine, mas desiste ao descobrir que ele tem um amor do passado que não conseguiu esquecer.
Finn tenta trazer um pouco do Natal para McKinley, e Artie descobre que Brittany ainda acredita no Papai Noel. Enquanto isso, os professores sorteiam seus amigos secretos e Sue tenta manipular as entregas a seu favor.
Treinadora Bieste e Mr. Schuester conspiram em unir o clube do carol e time de futebol; Sue tenta, desesperadamente, ganhar as nacionais das cheerleaders; New Directions fará uma performance de Thriller de Michael Jackson.
Chegou o Dia dos Namorados. No McKinley High todos estão apaixonados. Enquanto casais se formam, outros se separam. Sam e Quinn percebem que o relacionamento entre os dois existe apenas por interesse e decidem se afastar. Um amor sincero entre Puck e Lauren está prestes a começar devido a uma brincadeira "inocente". Rachel convence Brittany a mudar o visual, e Santana decide se trajar como Rachel por inveja. Artie se apaixona pelo novo visual de Brittany e junto dos amigos do New Directions prepara um serenata em comemoração ao namoro. Emma esconde um segredo. Kurt pensa em se declarar para Blaine, mas desiste ao descobrir que ele tem um amor do passado que não conseguiu esquecer.
